Muzeum Aveiro został założony w 1911 roku i mieści się w zabytkowym budynku dawnego klasztoru dominikańskiego Jezusa. Klasztor został zbudowany w 1458 roku. Fasada budynku, który widzimy dzisiaj, pochodzi z XVIII wieku. W budynku są trzy wejścia z pięknymi szczytami, a główny front budynku zdobi królewski herb. Obok wejścia stoi pomnik Świętego Joan (Janie).

Atrium byłego klasztoru teraz używany jako holu muzeum. Zachował się dom kapituły, gdzie odbywały się spotkania, i kościół, który pochodzi z XV wieku, z kolumnami w stylu Renesansowym, a także kilka folklorystycznych w stylu manuelińskim, ozdobione kafelkami "азулезуш". Wnętrze głównej kaplicy kościoła zdobią prace z drewna złotem XVI wieku. Ściany ozdobione kafelkami "азулезуш", na której przedstawione są sceny z życia Świętej Жуаны, również wiszą obrazy, na których przedstawiona jest ta święta.

W dolnej kaplicy, gdzie служилась liturgia, warto grobowiec, w którym spoczywają prochy księżniczki Жуаны, córki króla Afonso V. Grobu zaczęli budować na rozkaz króla Pedro II, ale proch księżniczki tam przeniesiono dopiero w 1711 roku. Grobowiec ozdobiony kolorową mozaiką, wykonane z włoskiego marmuru. Każda strona grobowce ozdobione ścienne przedstawiające sceny z życia księżnej, sufit kaplicy wykonany w stylu barokowym. Nad projektem grobowce pracował królewski architekt Manuel Антунеш.

Księżniczka Giovanniego przyjęła śluby zakonne w 1472г. i mieszkała w tym klasztorze aż do swojej śmierci w 1489 roku. Była znana ze swej dobroci, i, według legendy z nią związane były jakieś cuda. W 1673 jej uplasowali kanonizowany jako Święty Жуану.

Muzeum przechowuje bogatą kolekcję obrazów, rzeźb, płytek, mebli, wyrobów ceramicznych z okresu baroku.