Muzeum paleontologii umieszczono w mieście Helena i znajduje się w Попниколовом domu, jednym z najstarszych domów, które pozostały z okresu odrodzenia Bułgarii (ХVІІІ-XIX wieku). Muzeum jest zabytku i pomnik budowy narodowego znaczenia. W latach 1980-1981 to budynek w pełni odnowiony i przekazali uniwersytet w Sofii imienia Świętego Klemensa Ohrid edukacyjnych i naukowych celów. W tym czasie na niskim parterze w domu urządzono muzeum paleontologiczne, który został stworzony według pomysłu i pod naukowym kierownictwem akademika i profesora Тодора Николова. On uzyskał stopień doktora honoris causa Тулузского uniwersytetu we Francji.

W muzeum paleontologii zwiedzający mogą zobaczyć różne materiały ze zbiorów Тодора Николова i starszych pracowników naukowych Стойчо Бресковского i Кристалины Стойковой. Ponadto, tutaj znajduje się część znalezisk, które zostały otwarte przez studentów podczas ich praktycznego szkolenia w mieście Helena – szczątki różnych zwierząt prehistorycznych, fragmenty minerałów itp. Na innych piętrach Попниколового domu i po dziś dzień uczą się i pracują studenci i wykładowcy uniwersytetu w Sofii.

Sam budynek też jest szczególnie interesujące, ponieważ jest to typowa budowla z okresu Renesansu. Została ona wzniesiona około 1830 r., fasadami wychodzi na ulice Кыршовска i Stefana Йовчева. Ze strony ulic ten dom ma trzy kondygnacje – parter i dwa górne, a z wewnętrznej - tylko dwa piętra.

Budynek ten jest znany pod nazwą "Stary inżynieria", tak jak na początku, w pierwszych latach po Wyzwoleniu, tu mieściła się miejska техслужба. Później, w 1973 roku budowę oficjalnie ogłosili zabytku.