Legenda głosi, że pod koniec 17 wieku, za rządów biskupa Konstantyna Бжостовского, w miejscowości postanowili osiedlić się mnisi posady główne otrzymywali trynitarze. Z tego powodu obszar ten nazwano Тринополем, czyli miastem trynitarzy. Postanowili wybudować kościół, a przy nim klasztor. Kościół został zbudowany w okresie 1695-1709 lat i architektem był prawdopodobnie Petro Путини.

Według innych źródeł, kościół i klasztor został zbudowany w 1703 roku, przez biskupa Konstantyna Бжостовским. Kościół Najświętszej Trójcy, położony w mieście Wilnie, jest kościół rzymsko-katolickim kościołem na chwałę Najświętszej Trójcy.

Sam budynek kościoła i budynku przylegającego do niego dawnego klasztoru trynitarzy są zabytkami architektury i historii. Znajdują się one w północnej części miasta, na prawym brzegu rzeki Wilii. Pierwotnie kościół był drewniany.

W 1710 roku w kościele wybuchł niszczycielski pożar, wszystkie budynki spłonęły. Wtedy postanowiono budować kamienne kościół i budynki klasztoru. Zakończyła się budowa w 1722 roku. Właśnie wtedy zostały zbudowane górne partie wież. W latach 1750-1760 została przeprowadzona rekonstrukcja świątyni, w wyniku czego zyskał elementy późnego baroku.

W okresie Napoleońskiej okupacji w świątyni usytuowano szpital wojskowy armii francuskiej. Jak i wszystkie inne świątynie lub inne budynki, w których квартировались francuscy żołnierze, kościół został mocno zniszczony. Wnętrze kościoła ucierpiał najbardziej.

W 1832 roku, w wyniku polskiego powstania, klasztor został zniesiony, a kościół był zamknięty. Dziesięć lat później prawosławny metropolita ubiegał się o uzyskanie świątyni w użytkowanie swoich wiernych. W 1848 roku budynki zostały przekazane архиерейскому domu i prawosławnego klasztoru. Kościół został przemianowany na kościół Świętego Józefa Oblubieńca, jego przebudowy. Na terenie byłego klasztoru zostało opublikowane mały cmentarz prawosławny. Starą kaplicę znajdującą się obok, został wyremontowany i przekształcony w кладбищенскую kościół.

W latach 1917-1918 kompleks świątynny został zwrócony katolikom. W budynkach klasztoru znajduje się schronisko dla sierot i litewskiej szkoły. W 1926 roku w klasztorze znajduje się letnia rezydencja arcybiskupa.

Po zakończeniu ii wojny światowej Radziecka władza zamknęła i nacjonalizacji świątyni. Najpierw tutaj umieściliśmy szpitala, a później – bazę turystyczną.

W 1992 roku obiekt został ponownie zwrócony katolikom, swoim pierwszym gospodarzy. W klasztorze zdecydowano się umieścić nowicjatu Wileńskiego архиепископата i centrum rekolekcji. W 1997 roku kościół został wyremontowany i konsekrowany.

Kościół Najświętszej Trójcy, zbudowany w stylu późnego baroku. Fasada kościoła dwupoziomowy, podzielony różnych gzymsami i pilastrami. Z prawej i lewej strony, bezpośrednio z drugiego piętra elewacji, wznoszą się dwie wieże. Między nimi wybudowano trójkątny fronton. Pomalowana na żółty – kolor biały, pod czerwono-brązowym dachem, kościół wygląda majestatycznie i surowo, jak i wszystkie arcydzieła architektury późnego baroku. Kompleks jest ogrodzony metalowym płotem.

W procesie zmiany właścicieli oryginalny wystrój świątyni zostało zniszczone lub utracone. Jedyny historyczny mebel to drewniana rzeźba wykonana z elewacji wileńskiego kościoła Świętej Katarzyny. Rzeźba wykonana jest w stylu barokowym.

Analizując wydarzenia w życiu narodu litewskiego i państwa litewskiego, można zrobić wyraźną paralelę z losem kościoła Najświętszej Trójcy. On сгорал, zamykano i znowu otwierał się zmieniał swoich właścicieli, popadał w ruinę i znowu przywrócić. Przy tym zachował swój styl i swoją wielkość.