Franciszkański klasztor i kościół ss. Filipa i Jakuba znajdują się na wysokim płaskowyżu nad brzegiem Dunaju, w starej części Vukovaru. Kamień węgielny pod budowę świątyni poświęconej apostołów Filipa i Jakuba, został założony w 1723 roku. Budowa kościoła zakończyła się w ciągu 10 lat, w 1733 roku, a budynek klasztoru ukończono w 1736 roku. Później kościół był przebudowywany i przywrócone.

W latach 1896-1897 przeprowadzono remont i rozbudowa klasztoru i kościoła pod kierunkiem wiedeńskiego architekta Richarda Йордано. Po dany kościół zyskał długość 58 metrów, co czyni ją trzecią w Chorwacji po дяковского i загребского katedr.

Klasztor i kościół są typowymi budynkami w stylu "baroku Marii Teresy", opublikowanym w kontynentalnej Chorwacji.

Podczas serbskiej agresji kościół i klasztor ucierpiały, ponieważ były ponad 3000 uderzenia z powietrza. Duża część wartości została uratowana franciszkanów poza granicami Chorwacji.