Nia-in jest głównym świątyni buddyjskiej szkoły Jodo-shu, który w XII wieku założył mnich Хонэн, później zwany "Wielkim nauczycielem doskonałego świata". W oparciu im nauczanie stało się bardzo popularne wśród zwykłych mieszkańców Japonii, dziś Jodo-shu – jedna z najbardziej licznych sekt buddyjskich w kraju.

Świątynia została zbudowana uczniem Хонэна w pamięć o swoim nauczycielu w 1234 roku. Później cztery stulecia świątynia mocno ucierpiała od pożaru, ale został przywrócony na rozkaz szoguna Tokugawa Иемицу, który rządził w pierwszej połowie XVII wieku. Podczas jego panowania świątyni zbudowano ogromne bramy Саммон (najwyższe w Japonii, wysokość 24 m) i pojawiły się domki. Na belkach dachowych przedstawiciel klanu Tokugawa polecił przedstawić swoje rodzinne znaki, i od tego czasu wygląd świątyni nie zmieniał.

Możliwe, że od ognia świątynia chroni tzw. "zapomniany parasol" - przedmiot, który znajduje się na jednej z belek głównego budynku świątyni. Szkielet parasola do połowy wysunięty nawet półtorametrową wysokość. On dobrze widoczny dla odwiedzających, ale ludzka ręka nie dotykała do niego w ciągu kilku wieków. Istnieje kilka wersji tego, jak parasol okazał się pod dachem. Według jednej z nich, parasol zostawił cieśla, aby chronić kościół przed złymi duchami i odpala. Według innej wersji, nie ma zostawiła biała lisica w podzięce za wybudowany nowy dom. Nie jest wykluczone, że parasol został po prostu zapomniane. Jednak sami japończycy cenią sobie tę romantyczną legendę.

Takich tajemniczych opowieści związanych z kościołem Tion in, kilka – oprócz parasola, w świątyni znajdują się jeszcze sześć przedmiotów z niezwykłymi właściwościami lub mistycznych wartościami. Tak, w budynku głównym Миэйдо podłogi w korytarzu nazywają "соловьиными" za to, że głośno piszczą, nawet jeśli na nich lekko nadchodzą. Końce deski окованы metalu, które ocierają się o siebie i wydają głośny dźwięk. Skrzypiące podłogi – jedna z obszarami działań podejmowanych w japońskim Średniowieczu. Na jednym ze zdjęć w świątyni namalowano kot, zdaniem której skierowany na osobę, w jakim punkcie pomieszczenia nie był. Jeszcze jedna legenda "ożywiła" wróbli, które zostały namalowane na jednej ze ścian świątyni. Ptaki zostały przedstawione tak umiejętnie, że rzekomo ożyły i упорхнули. Oprócz tego, w świątyni znajduje się łyżka o wadze ponad 30 kg i długości około 2, 5 m – ona symbolizuje miłosierdzie Buddy Amida. Jeszcze tutaj znajduje się kamień, na którym kiedyś wzrosła бахчевое roślina. Według jednej legendy, kamień zamyka wejście do podziemnego korytarza, który prowadzi do zamku Nijo, według innej wersji, kamień – to kawałek meteorytu spadł. Jest tutaj i na znak pamięci o małżeńskiej pary stolarzy, którzy budowali bramy Саммон i popełniło samobójstwo, kiedy okazało się, że koszty budowy przekroczyły planowane wydatki.

Kolejną atrakcją kościoła jest ogromny dzwon o wadze 74 tony. Aby wydał dźwięk, wymagana moc 17 mnichów.