Kościół Matki Boskiej Miłosierdzia (La Merced) umieszczono w pobliżu Plaza de Armas, w historycznym centrum Cusco. Z powodu trzęsienia ziemi, które miały miejsce w tym mieście, świątynia Miłosierdzia został przebudowany i odnowiony kilka razy.

Pierwszy budynek kościoła został wzniesiony w 1535 roku na ziemi, пожертвованной markizem Francisco Pizarro. Prawdziwy kościół zastąpił pierwszy kościół, zniszczony w 1650 roku przez trzęsienie ziemi. Główne wejście do kościoła, wykonane w stylu Renesansu, jest znacznie mniej znany niż boczne wejście, które jest używane teraz jako stałego. Budowa nowego budynku kościoła prowadzono w okresie 1651-1659 rok architektów Martin-de Torres i Sebastian Martinez. Świątynia wykonana jest w stylu neoklasycznym, ozdobione kolumnami, kilkoma bocznymi ołtarzami i obrazem matki Bożej Miłosierdzia w centralnej części świątyni. Wewnątrz krypty, który znajduje się pod głównym ołtarzem kościoła, znajdują się szczątki Gonzalo Pizarro, Francisco de Carvajal, Diego de Almagro Starszego (partnera Pizarro) i Almagro Młodszy (syn Diego (kalifornia)).

Budynek klasztoru świątyni Miłosierdzia uważają, że prawdziwym arcydziełem. Cała konstrukcja budynku wykonana jest z kamienia. Jego półkoliste łuki na małych rzeźbionych kolumnach, powtarzają się na górnej kondygnacji, co tylko dodaje lekkości konstrukcji. Z tego powodu jest uznawany za opracowanie projektu klasztoru architekta Торресу, choć niektórzy badacze są pewni, że klasztor został zbudowany Diego Martinez de Oviedo, który należy do innego pokolenia architektów.

Budynek klasztoru ma kwadratowy kształt z łukowatym wejściem, grube prostokątne kolumny i licznymi freskami na ścianach, ilustrujących życie świętych. W centrum klasztoru podzielona jest piękny kwitnący ogród. W klasztorze mieści się ekspozycja muzeum w świątyni Miłosierdzia.

Coroczne święto Matki Bożej Miłosierdzia, patronki tej świątyni, obchodzony 24 września pięknej procesji na ulicach miasta Cusco.