W 1444 roku na obrzeżach miasta Боровска, obwód kałuski, na najwyższym miejscu, gdzie rzeka Истрема wpada do rzeki Протву, został założony męski Пафнутьево-Borowski klasztor. Klasztor nazwany na cześć swojego założyciela – opata Paphnutius.

W 1467 roku zamiast drewnianego kościoła został zbudowany białym, kamiennym cokole katedra pod tytułem boże Narodzenie. Później kościół nie przetrwał. Sanktuarium Narodzenia Nmp słynie z tego, że malowidła, którymi był ozdobiony – to były jedne z pierwszych dzieł wielkiego malarza ikon Dionizy. Wszystkie malowidła Dionizy wykonywane pod kierownictwem starszego Simonowa klasztoru — иконника Митрофана.

W 1586 roku, w latach panowania cara Fiodora Iwanowicza, sobór został rozebrany i na jego miejscu zbudowano nowy, пятиглавый. Materiałem do budowy fundamentów nowego kościoła były белокаменные bloki z obrazami malarza ikon Dionizy XV wieku. W ten sposób, fragmenty prac malarza ikon Dionizy i иконника Митрофана zachowały się do naszych czasów i są przechowywane w Боровском oddziale Kaluga państwowego arsenyev i w Centralnym muzeum starożytnej kultury i sztuki im. Andrzeja Rublowa w Moskwie.

W XVI wieku klasztor ogrodzone kamiennymi ścianami, siedziba zaczęła służyć granicznej twierdzy. W tym samym wieku wzniesiono kościół w imię bożego Narodzenia z kamiennej sali bankietowej. W 1523 roku wzniesiona została dzwonnica, a w 1688 roku został zastąpiony dzwonnicą.

Mury i wieże Пафнутьево-Боровской mieszkań odnoszą się do budynków z XVI—XVII wieków. Istnieje wersja, że George, Zbrojownia i Kucharska wieży klasztoru powstały pod kierunkiem słynnego architekta, autora budowli Białego miasta w Moskwie, Smolensk kremla i Simonowa klasztoru - Fedor Савельевича Konia. Jednak specjaliści naszego czasu twierdzą, że ściany Пафнутьево-Borovský klasztoru i najstarsza okrągła wieża, która zachowała się do naszych czasów, zostały zbudowane po zakończeniu budowy katedry i dzwonnicy tego samego architekta. Pozostałe wieże: Тайницкая, George zostały odrestaurowane po zniszczeniach klasztoru w czasach trudnych czasach w 1635 roku mistrzem Трофимом Шарутиным, a najnowsze wieże: Stróżujący i Wejście odnowiono w 1636 roku lub po. Należy zauważyć, że plan twierdzy została obliczona na obronę plenerowy "приступной" ściany, co jest charakterystyczne dla XIV-XV wieku, t.do. wieże zbudowane w niewielkiej odległości od siebie, na linii podłogowych strony twierdzy zostały obliczone na aktywny opór i jednocześnie wykonywali architektoniczną funkcję głównego elewacji klasztoru.

W 1610 roku od polaków klasztor bronił książę Michał Волконский, ale został schwytany i spalony.

W okresie reform patriarchy Nikon biskup Paweł Kołomna, ks Полиект Borowski i niektóre inne z przywódców klasztoru wystąpili przeciwko reform kościelnych. Później przeciwnicy reform byli represjonowani, a biskup Paweł Kołomna i hieromnicha Полиект Borowski zostały wykonane.

Po reformach przeprowadzonych przez patriarchę Никоном, Пафнутьево-Borowski klasztor zaczął podupadać. Za rządów Katarzyny II w klasztorze zostawili 33 mnicha nowicjusza, a niemal wszystkie należące do Пафнутьево-Боровскому klasztoru majątku zostały wybrane. W 1812 roku francuzi spalili klasztor, ale po pożarze udało się go odzyskać.

W 1923 roku nieruchomości należących do Пафнутьево-Боровскому klasztoru przekazano w zarząd Главмузею, ale szybko się w nim został wysłany " colonia, a po – сельхозтехникум. W latach 1960-tych, przy pracach konserwatorskich znaleziono 194 белокаменных bloku, i tylko na 29-cio zachowały się fragmenty scen dekoracyjnego malarstwa, датирующиеся początkiem XVI wieku.

W 1991 roku klasztor przekazano Rosyjskiej cerkwi Prawosławnej, a w marcu tego samego roku został otwarty. Relikwie św Paphnutius Borovský, założyciela klasztoru, są przechowywane w Bożonarodzeniowym katedrze.