Muzeum morskie znajduje się w dzielnicy Minato Mirai i poświęcony historii morskiej Japonii. Został otwarty w 1993 roku. Głównym eksponatem muzeum morskiego szkolny żaglowiec Nippon Maru, który był zwodowano w 1930 roku, a obecnie znajduje się u podnóża wieży Landmark Tower.

Muzeum należy do dużej firmy spedycyjnej nyköping city Line, której historia bierze początek w 1870 roku. Obecnie jej flota liczy 776 statków, biura firmy są otwarte w 27 krajach na całym świecie, w tym w Rosji. Firma wchodzi w Mitsubishi Group.

Muzeum opowiada o historii Yokohama jako jednego z portów w Japonii, które w XIX wieku były otwarte dla handlu międzynarodowego. Uważa się, że otwarcie Japonii reszty świata stało się w dużej mierze dzięki elbląskiemu Matthew Perry, politykę i oficer Marynarki wojennej USA. W latach 1852-1854 z powodzeniem przeprowadził dwie misje dyplomatyczne, w wyniku których między USA i Japonią został podpisany Канагавский umowy, ослабивший самоизоляцию Kraju wschodzącego Słońca. Wyprawy Perry zostały czwartej i piątej próbie USA ustawić handlowe i dyplomatyczne stosunki. Perry kazano użyć siły, jeśli Japonia zrezygnuje z prowadzenia negocjacji. Jego statki strzelali w powietrze i zezwalali kłęby czarnego dymu, dlatego japończycy nazywają eskadra "czarnej".

Ekspozycja w muzeum opowiada o tym, jak rozwijała się japońskie i światowego przemysłu stoczniowego z połowy XIX wieku, o nowoczesnych technologiach w tej branży i o znaczeniu portu Yokohama. Tutaj znajdziesz wielki zbiór modeli nowoczesnych i zabytkowych statków, kolekcja książek o przemyśle stoczniowym.

Żaglówka Nippon Maru – четырехмачтовый statek o długości 300 metrów. Przez lata swojej pracy odbył się, według szacunków ekspertów, 1, 8 mln kilometrów i jako narzędzie statku przygotował do morskiej służby około 11, 5 tys. osób. Był zwodowano w styczniu 1930 roku. Po zakończeniu ii wojny Światowej używano go do repatriacji ludzi z byłych kolonii Japonii. W 1984 roku Nippon Maru zakończył służbę i został zacumowany u podnóża Wieży Landmark.