Zoo i muzeum przyrody w Splicie pojawiły się dzięki który dostali jako prezent mieście na początku XX wieku wielu cennych naturalnych zbiorów. Profesor Umberto Джирометта w 1923 roku postawił pytanie o tworzeniu Muzeum historii naturalnej. Rada gminy w Splicie przyjął tę kwestię do rozpatrzenia i w 1924 roku powstało pierwsze muzeum, a Джирометта został jego kierownikiem aż do swojej śmierci w 1939 roku.

W pierwszych latach swego istnienia muzeum znajdował się w jednym z budynków w centrum miasta. Wkrótce pomieszczeń stało nie można przegapić, i muzeum przeniesiono do jednego z budynków parku Marjan. Wraz z muzeum został otwarty małe zoo, представлявший niektóre rodzaje lokalnych i egzotycznych zwierząt. Dla pierwszego na terenie byłej Jugosławii Oceanarium obok budynku muzeum zbudowano dodatkowy pokój. Kilka lat później Oceanarium została zamknięta i zamieniona w małe terrarium. Dziś zoo w Splicie liczy ponad 300 gatunków zwierząt.

Budynek w parku Marjan w czasie działań wojennych w 1991 roku została zamknięta ze względów bezpieczeństwa. Następnie muzeum przeniósł się do twierdzy Грипе, a po 1997 roku ponownie wrócił do Marian. Po 2000 roku, na wniosek pracowników, pod potrzeby Muzeum przeznaczono nową przestrzeń, o łącznej powierzchni około 1156 mkw, w którym Muzeum rozpoczął pracę w styczniu 2002 roku.

Przed otwarciem nowym dyrektorem muzeum została przeprowadzona reorganizacja muzeum, переучтены kolekcji i dodano kilka nowych wystaw (np. kolekcja wypchanych zwierząt i ptaków, dział geologii i paleontologii, entomologii, dział kręgowców i bezkręgowców, itp.). Prowadzone były również działania w zakresie przetwarzania i porządkowania eksponatów, badania terenowe w środkowej części Dalmacji, liczne wystawy tematyczne w muzeum i poza nim. Ponadto, pracownicy Muzeum uczestniczą w licznych konferencjach naukowych.

Na pierwszym piętrze muzeum odbywają się różne wystawy tematyczne, a na pozostałych piętrach znajdują się stałe ekspozycje. Każdy może kupić w muzeum dodatkowe materiały na temat historii muzeum lokalnej historii naturalnej.