Sanktuarium Suwa-jinja przybytek został zbudowany w okresie prześladowań chrześcijan i był przeznaczony do tego, aby zwrócić japończyków w łonie jednej z tradycyjnych religii shinto. Święta i festiwale, przeprowadzone w świątyni, musieli pokazać którzy planują przyjazd w Nagasaki europejczycy piękno japońskiej kultury. Dziś Suwa-jinja przybytek jest głównie z shinto świątyń i centrum синтоистской społeczności miasta. Jest on położony w jego północnej części, na zboczu góry Тамадзоно-san. Aby wejść do świątyni, trzeba przejść po schodach z 277 stopni.

Budowę świątyni rozpoczęto w 1614 roku, kiedy władca Tokugawa Ieyasu wydał dekret, który stał się początkiem prześladowań chrześcijan. Ieyasu uznał rozszerzanie europejskiej religii zbyt szybki i agresywny, widział w nim zagrożenie dla tradycyjnych religii, integralności japońskiego społeczeństwa i państwa urządzenia. W tym czasie zaczęto budować синтоистские sanktuarium, a japończycy zaczęli zmuszać do исповеданию shinto i buddyzmu.

Dziesięć lat później, w 1624-m, do miasta przybył działacz religijny Aoki Kensei, który, aby przyciągnąć mieszkańców do nowej świątyni lansowania ютате-sy – rytuał, podczas którego kapłan wsuwał ręce do wrzątku i wyjąć je bez jednego poparzenia. Ale to "show" na liczebność parafian praktycznie nie wpłynęło. Wtedy w 1634 roku mieszkańców zostały zobowiązane zarejestrować się w świątyni i zaczęli przeprowadzać jesienią duży festiwal. Z pomocą tych dwóch środków władze mówiły na temat tajnych chrześcijan: nie dokonali rejestracji i nie посещавшие święto zostali aresztowani, torturowani i mordowani.

Suwa-jinja przybytek poświęcony bóstwu Suwa-ale-Kami, który jest czczony jako bóstwo męstwa i długu, a jego sanktuarium znajdują się w całej Japonii. Również w tym kościele czczony jeszcze dwóch bóstw – Сумиеси, boga morza, i Моридзаки. W sądzie nich spędzają festiwal Kunti, najbardziej znany z wszystkich świąt Suwa-jinja przybytek. Odbywa się on w dniach 7-9 października każdego roku i jest tym samym największym i najbardziej znanym festiwalem, jak Gion Matsuri.

Obecnie 3 marca w kościele również odbywa się Festiwal lalek, podczas którego młode japonki noszą odświętne kimono i uczestniczą w procesji. Do udziału w procesji przechodzą konkurs, a na podstawie wyników dwóch najpiękniejszych wybierają się do roli cesarza i jego małżonki, którzy na czele procesji. Uważa się, że jest to impreza reklamuje синтоистское sanktuarium.

W Suwa-jinja przybytek każdy rok 9 sierpnia odbywa się pamiątkowa służba w pamięć o tych, którzy zginęli od wybuchu bomby atomowej. Rytuał łączy w sobie elementy синтоистской, buddyjskiej i chrześcijańskiej usług, podczas niego modlą się za ponad 70 tysięcy ludzi, którzy zginęli podczas nalotu w 1945 roku. Sama świątynia przetrwała atomową bombardowania, jego kapłani uczestniczyli w odbudowie Nagasaki, uświęcania ziemię i oczyszczając ją z gruzów budynków.