Muzeum Św. Augustyna znajduje się na terenie zabytkowego манильского dzielnicy Intramuros. Jest on częścią Kościoła Św. Augustyna, który z kolei jest wpisana na listę Światowego Dziedzictwa UNESCO. Kościół, zbudowany w 1587 – 1604 r., jest jednym z najstarszych działających kościołów Manili.

Muzeum Św. Augustyna ma kształt kwadratu z dużym wewnętrznym dziedzińcem. Sam budynek składa się z dwóch pięter z 4 холлами i przedpokoju na całej długości budynku. Warto zauważyć, że wewnątrz muzeum zabronione jest robienie zdjęć.

W sali "Sala De La Capitulacion" można zobaczyć zabytkowe kościelne artefakty i statuetki. To właśnie w tym pomieszczeniu zostały sporządzone warunki kapitulacji i przekazywania kontroli nad Filipinami od hiszpanów amerykanom w pod koniec 19 wieku. W zakrystii muzeum przechowywane są figurki i obrazy, wykonane w 17 wieku, w tym złoty ołtarz, wykonany w 1650 roku. Krypta uderza misternej roboty sufitem z ацтекскими freskami.

Idąc w górę po schodach starej z chińskiego granitu, można znaleźć się w sali Św. Pawła, gdzie stoi makieta kościoła i muzeum. W sali Św. Augustyna prezentowane są obrazy i zdjęcia, na których widnieją kościoła, zbudowanych przez mnichów-августинцами na Filipinach. W Porcelanowej Pokoju znajduje się zbiór porcelany. Obok muzeum jest ogród Ojca Blanco – był botanikiem-amatorem, studiował rośliny, jego szczególną pasją były rośliny lecznicze. W 1883 roku on nawet napisał i opublikował książkę "Flora wysp Filipińskich".

Kościół i Muzeum Św. Augustyna i dziś pozostają prawdziwymi strażnikami przeszłości, świadkami bogatej historii Filipin i niesamowitej kultury filipin.