Muzeum miejskie w Kobe został otwarty w 1982 roku. Jest to jeden z wielu muzeów w Japonii, które istnieją przy wsparciu gminy. Mieści się on w budynku, wybudowanym w stylu neoklasycyzmu w 1935 roku. Budynek muzeum przypomina grecki świątynia z kolumn doryckich na frontonie. Do muzeum w nim znajdował się oddział banku Tokio. Budynek został uszkodzony w czasie Wielkiego trzęsienia ziemi Хансин 1995 roku, jednak już rok później, po renowacji muzeum wznowił swoją pracę. Warto zauważyć, że w kolekcji muzeum, w tym znajdujące się tam skarby narodowe, nie ucierpiały.

Kolekcja muzeum zjednoczyło kolekcji dwóch muzeów – muzeum archeologii i sztuki i miejskie muzeum sztuki Намбан XVI wieku (lub "południowych barbarzyńców", jak nazywano w Japonii wszystkich cudzoziemców, na początku portugalczyków, a następnie innych europejczyków, którzy mieszkają na południu kraju).

Kolekcja liczy 39 tysięcy przedmiotów, wśród których znaleziska archeologiczne, dzieła sztuki, stare mapy geograficzne i historyczne dokumenty, a także przedmioty związane z historią miasta Kobe. Historia miasta jest tutaj przedstawiona, począwszy od czasów starożytnych aż do trzęsienia ziemi w 1995 roku i odbudowie miasta. W osobnej ekspozycji prezentowane są przedmioty, znalezione w okolicy Kitano-te na tych ziemiach, które kiedyś należały do zagranicznych концессиям.

Tak jak Kobe od dawien dawna jest portem międzynarodowym, zdecydowano się określić koncepcję muzeum miejskiego w interakcji wschodniej i zachodniej kultury. W ekspozycjach muzeum prezentuje historię wymiany kulturalnej Japonii z krajami Azji Wschodniej – Koreą, Chinami, a także kultura Japonii okresu Edo, kiedy bezpośrednie połączenia z innymi krajami praktycznie nieobecne, i okresu Meiji, gdy kultura europejska miała, być może, najbardziej wymierny wpływ na życie japończyków.