W centrum miasta Heraklion, w pobliżu muzeum Archeologicznego znajduje się Muzeum obrony Krety. Muzeum zostało założone przez gminę w Heraklionie w 1994 roku i jest poświęcony obronie Krety i komisarzowi ruchu oporu w okresie ii wojny światowej. Celem muzeum jest gromadzenie, ochrona i prezentacja zabytków, 1941-1945, zgodnie z oczekiwaniami, a także dokumentowanie i rozpowszechnianie informacji o walce ludzi podczas bitwy o Kretę i niemiecko-włoskiej okupacji.

W ekspozycji muzealnej zgłoszony przez tysiące oryginalnych zdjęć, obrazów i rysunków bitwy o Kretę i narodowego ruchu oporu, około 200 książek, monografii, esejów historycznych wydarzeń z 1941 do 1945 roku, setki dokumentów i publikacji prasowych. W muzeum prezentowane są również różne przedmioty związane z wojną: forma broni, różne akcesoria, przedmioty codziennego użytku i wiele innych.

Główna część wystawy eksponatów oświetla "Bitwy o Kretę w maju 1941 roku. Ta bitwa jest jedną z największych w historii ii wojny światowej airborne operacją i jest znany także jako "Operacja Merkury". Głównym celem niemieckich najeźdźców było wyparcie wielkiej Brytanii z morza Śródziemnego i ustanowienie strategicznego kontroli nad basenem Śródziemnomorskim. Organizatorem pospolitego ruszenia był brytyjski archeolog, pracował dla wywiadu brytyjskiego, John Пендлбери. Mimo wielu strat, niemcy wygrali bitwę.

W muzeum ma swój ośrodek badawczy, którego pracownicy koncentrują się na zbieraniu materiałów archiwalnych wojennych różnych krajów (1940-1945) i ich tłumaczenie. Działalność muzeum ma na celu zwrócenie uwagi młodego pokolenia do historii krety narodu i świadomość mocy niszczącej wojny.