Jaskinia Gellerta jest częścią sieci jaskiń na górze Gellerta. Jaskini nazywają "jaskini Świętego Jana" w imieniu pustelnika, który żył tam, i uważa się, który używał naturalne wody termalne jezioro w pobliżu jaskini do uzdrawiania chorych. Całkiem prawdopodobne, że to te same wody, że trafiają w baseny kąpielisk Gellerta.

W 19 wieku jaskinia była schronieniem biednej rodziny, która, jak mógł, обустроила naturalne domu. Wejście do jaskini zostało zamknięte. Ilustrację tego okresu historii można zobaczyć na zdjęciu Mihai Myra, датированную 1860-miu lat i na zdjęcia Дьердя Klesia 1877 roku.

W 1920 roku grupa mnichów, inspirowana podczas pielgrzymki kamiennymi zabudowaniami Lourdes we Francji, обустроила jaskini po swojemu i nożyce wejście. Od 1926 do 1951 roku jaskinia służyła jako kaplica, a nawet klasztoru. W czasie ii wojny światowej mieścił się tu szpital polowy armii niemieckiej. W 1945 roku armia Czerwona wyzwoliła Budapeszt. W ciągu sześciu lat jaskinia zaczęła pełnić funkcje religijne, ale w 1951 roku w ramach wzmocnienia represji, skierowany przeciwko kościołowi, organy bezpieczeństwa przeprowadzili rewizje w kaplicy. Jaskinia była zamurowana, starszy brat Ferenc Weser skazany na karę śmierci, mnisi – do zawarcia w terminie do dziesięciu lat.

Kaplica została ponownie odkryta 27 sierpnia 1989 roku – gruba betonowa ściana zamykająca wejście, została zniszczona. Do 1992 roku kaplica została odbudowana i uporządkował. Obecnie w jaskini odbywają usługi, bez względu na to, że jest atrakcją turystyczną.